Status Terkini Penyakit Tristeza Pada Tanaman Jeruk di Sulawesi Tenggara

Current Status of Citrus Tristeza Disease in Southeast Sulawesi

Penulis

  • Prof. Muhammad Taufik Jurusan Proteksi Tanaman, Universitas Halu Oleo
  • Sari Nurulita Departemen Proteksi Tanaman, Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor
  • Dewi Nurhayati Yusuf1 Jurusan Proteksi Tanaman, Universitas Halu Oleo
  • Miftahkuhrohmah Badan Riset dan Inovasi Nasional
  • Muhammad Botek Jurusan Proteksi Tanaman, Universitas Halu Oleo
  • Gusnawaty HS Jurusan Proteksi Tanaman, Universitas Halu Oleo
  • Elisa Syarni Jurusan Proteksi Tanaman, Universitas Halu Oleo

DOI:

https://doi.org/10.14692/jfi.21.1.28-37

Kata Kunci:

citrus tristeza virus, closterovirus, DAS-ELISA, epidemiologi, RT-PCR

Abstrak

Penyakit tristeza yang disebabkan oleh citrus tristeza virus (CTV, genus Closterovirus, famili Closteroviridae) merupakan salah satu penyakit penting pada tanaman jeruk di dunia, termasuk di Indonesia. Hingga kini, informasi dan studi terkait CTV di Indonesia masih terbatas. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui status terkini infeksi CTV di Provinsi Sulawesi Tenggara. Survei dan pengambilan sampel dilakukan secara purposive sampling di empat kabupaten. Deteksi dan identifikasi virus dilakukan dengan teknik double antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA), reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), dan analisis perunutan nukleotida. Hasil DAS-ELISA menunjukkan bahwa semua sampel dengan berbagai variasi gejala dari empat kabupaten terkonfirmasi positif terinfeksi CTV dengan nilai  titer virus yang beragam. RT-PCR dengan primer spesifik berhasil mengonfirmasi keberadaan CTV dari semua sampel dengan teramplifikasinya DNA berukuran 630 pb. Analisis sekuen  dan  filogeni menunjukkan bahwa isolat CTV asal Sulawesi Tenggara memiliki kemiripan tertinggi (97.9%) dengan isolat CTV asal India (MT498411.1) dan mengelompok satu grup dengan isolat asal India (MT498411.1), Jepang (U56902.1), dan Cina (MZ692538.1). Hasil penelitian ini mengonfirmasi penyebaran CTV pada empat kabupaten di Sulawesi Tenggara. Data molekuler diharapkan menjadi basis data untuk studi epidemiologi molekuler dan strategi pengendalian penyakit tristeza di Indonesia.

Unduhan

Data unduhan tidak tersedia.

Referensi

Badan Pusat Statistik. 2023. Produksi tanaman buah-buahan. https://www.bps.go.id/linkTableDinamis/view/id/960 [diakses 10 Jan 2025].

Budiarto R, Mubarok S, Sholikin MM, Sari DN, Khalisha A, Sari SL, Rahmat BP, Ujilestari T, Adli DN. 2024. Vitamin C variation in citrus in response to genotypes, storage temperatures, and storage times: a systematic review and meta-analysis. Heliyon. 10(e29125):1–17. DOI: https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e29125.

Dovas CI, Hatziloukas E, Salomon R, Barg E, Shiboleth Y, Katis NI. 2001. Comparison of methods for virus Detection in Allium spp. Journal of Phytopathology. 149:731–737. DOI: https://doi.org/10.1046/j.1439-0434.2001.00705.x.

Dwiastuti ME, Widyaningsih S. 2016. Ketahanan aksesi jeruk seedles terhadap tiga strain virus tristeza jeruk. Jurnal Hortikultura. 26(2):235–244. DOI: https://doi.org/10.21082/jhort.v26n2.2016.p235-244.

Ghosh DK, Kokane A, Kokane S, Mukherjee K, Tenzin J, Surwase D, Deshmukh D, Gubyad M, Biswas KK. 2022. A Comprehensive analysis of citrus tristeza variants of Bhutan and across the world. Frontiers in Microbiology, 13:1–17. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.797463.

Hall TA. 1999. BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium series. 41:95–98.

Kokane A, Lawrence K, Surwase D, Misra P, Warghane A, Ghosh DK. 2020. Development of reverse transcription duplex PCR (RT-d-PCR) for simultaneous detection of the Citrus tristeza virus and Indian Citrus ringspot virus. International Journal of Innovative Horticulture. 9(2):131–138. DOI: https://doi.org/10.5958/2582-2527.2020.00016.0.

Nurulita S, Hidayat SH, Mutaqin KH, Undaharta NKE. 2023. Status terkini infeksi Citrus tristeza virus di indonesia: Studi kasus pada pertanaman jeruk di Kabupaten Bangli, Provinsi Bali. Di dalam: Seminar Ilmiah Dan Kongres Perhimpunan Fitopatologi Indonesi XXVII; 2023 Juli 27-29; Lampung (ID): Universitas Lampung. Hlm 146.

Moreno P, Lopez C, Ruiz-Ruiz S, Pena L, Guerri J. 2022. From the smallest to the largest subcellular plant pathogen: Citrus tristeza virus and its unique p23 protein. Virus Research. 314:198755. DOI: https://doi.org/10.1016/j.virusres.2022.198755.

Muhire BM, Varsani A, Martin DP. 2014. SDT: a virus classification tool based on pairwise sequence alignment and identity calculation. PloS One. 9(9):e108277. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0108277.

Puspitaningtyas K. 2024. Incidence and detection of citrus tristeza virus infecting citrus in West Java. [skripsi]. Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.

Rizal M, Mutaqin KH, Suastika G. 2016. Deteksi dan evaluasi keragaman genetika candidatus liberibacter asiaticus sebagai penyebab penyakit huanglongbing di indonesia berdasarkan gen β-operon. Jurnal Fitopatologi Indonesia. 12(5):168–177. DOI: https://doi.org/10.14692/jfi.12.5.168.

Ratu S, Taufik M, Khaeruni A. 2020. Insidensi penyakit Citrus vein phloem degeneration ( CVPD ) dan kepadatan populasi serangga vektor Diaphorina citri pada tanaman jeruk di Pulau Siompu Kabupaten Buton Selatan. Jurnal Berkala Penelitian Agronomi. 8(1):33–39. DOI: https://doi.org/10.33772/bpa.v8i1.13854.

Rubio L, Galipienso L, Ferriol I. 2020. Detection of plant viruses and disease management: relevance of genetic diversity and evolution. Frontiers in Plant Science. 11(1092):1–23. DOI: https://doi.org/10.3389/fpls.2020.01092.

Sakamoto S, Putalun W, Vimolmangkang S, Phoolcharoen W, Shoyama Y, Tanaka H, Morimoto S. 2018. Enzyme-linked immunosorbent assay for the quantitative/qualitative analysis of plant secondary metabolites. Journal of Natural Medicines. 72(1):32–42. DOI: https://doi.org/10.1007/s11418-017-1144-z.

Tamura K, Stecher G, Kumar S. 2021. MEGA11: molecular evolutionary genetics analysis version 11. Molecular Biology and Evolution. 38(7):3022–3027. DOI: https://doi.org/10.1093/molbev/msab120.

Taufik M. 2000. Uji ketahanan berbagai kultivar jeruk terhadap Citrus tristeza virus. [Tesis]. Bogor (ID): Institut Pertanian Bogor.

Taufik M, Bande LOS. 2002. Deteksi keberadaan Citrus tristeza virus (CTV) dan serangga vektornya pada jeruk siompu di Provinsi Sulawesi Tenggara. Habitat. 8(3):185–192.

Taufik M, Khaeruni A, Pakki T, Giyanto G. 2010. Deteksi keberadaan Citrus Vein Phloem Degeneration (CVPD) dengan teknik PCR (Polymerase Chain Reaction) di Sulawesi Tenggara. Jurnal Hama dan Penyakit Tumbuhan Tropika. 10(1):73–79. DOI: https://doi.org/10.23960/j.hptt.11073-79.

Tuwo M, Kuswinanti T, Nasruddin A, Tambaru E. 2024. Uncovering the presence of CVPD disease in citrus varieties of South Sulawesi, Indonesia: a molecular approach. Journal of Genetic Engineering and Biotechnology. 22(1):1–8. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jgeb.2023.100332.

Unduhan

Diterbitkan

2025-10-30

Cara Mengutip

Taufik, . M., Nurulita, S., Yusuf, D. N., Miftahkuhrohmah, M., Botek, M., Gusnawaty HS, G. H., & Syarni, E. (2025). Status Terkini Penyakit Tristeza Pada Tanaman Jeruk di Sulawesi Tenggara: Current Status of Citrus Tristeza Disease in Southeast Sulawesi. Jurnal Fitopatologi Indonesia, 21(1), 28-37. https://doi.org/10.14692/jfi.21.1.28-37